# DrugFlow-Molstar 可视化界面操作

# 1. 整体界面介绍

界面如图 1 所示，其中正上方是操作按钮（从左到右依次是选择工具、2D 相互作用、截图、居中视图、自动旋转、全屏）；右上方是结构树；下方是序列。

图 1 显示界面

# 2. 鼠标

鼠标左键+单击：选择 鼠标左键+拖动：旋转 鼠标滚轮+滚动：放大/缩小 鼠标右键+拖动：平移 鼠标右键+单击：单击结构（聚焦到该结构处）；单击空白（居中视图）

# 3. 操作按钮

# 3.1 选择工具

单击选择工具，界面如图 2 所示，大致分为四个部分：粒度、操作、扩展选区、快速选择。

图 2 选择工具

粒度

• 链：鼠标左键单击，每次选中一条链
• 残基：鼠标左键单击，每次选中一个残基
• 原子：鼠标左键单击，每次选中一个原子

操作

• 全选：选中界面所有结构
• 取消选择：取消所有选择
• 反选：选中界面所有结构（除了当前已选择的）

扩展选区

• 选中当前所选结构周围指定范围内所有的结构，默认为 5Å

快速选择

• 快速选择所有链/某条链/所有配体/某个配体/所有水分子

# 3.2 2D 相互作用

显示界面分子的 2D 相互作用（只在结果页面可展示）。

# 3.3 截图

保存当前界面为图片。

# 3.4 居中视图

居中显示所有结构。

# 3.5 自动旋转

自动旋转当前界面显示的结构。

# 3.6 全屏

全屏显示当前结构。

# 4. 结构树

单击结构树，并单击展开，即“>”，如图 3 所示。结构树大致分为两个层级，第一个层级为 Model，即界面所有结构；第二个层级包括 Polymer、Component、Water 等。

图 3 结构树示意图

操作

• 点击“眼睛”，可隐藏/显示对应结构
• 点击 Model 后的“+”，可增加组件，即 Polymer、Component 等
• 点击 Polymer、Component、Water 等后的“+”，可添加表示，即 Cartoon、Stick 等
• 点击“删除”，可删除对应的组件或者表示（仅删除显示，具体结构还在文件中）

编辑表示 当我们点击某个表示后的“设置”，会出现编辑表示，如图 4。编辑表示分为三部分：透明度、颜色和删除表示。

• 透明度：范围是 0-1，越接近 0 越透明
• 颜色：有四种自动的颜色设置方式，包括元素符号、链 ID、统一、疏水性
• 删除表示：点击可删除该表示

图 4 编辑表示

##序列 默认选择 Chain，如图 5 所示。点击 Chain，有三种不同的选项：

• Chain，显示某条链的序列
• Polymers，显示多聚体的序列，例如所有蛋白链
• Everything，显示所有结构，包括蛋白、配体、水等

点击序列的某个残基，该残基会在序列中以绿色背景标记，同时在 3D 区域被选中。

图 5 序列

# 5. 已选择残基添加表示

当我们通过选择工具或者点击序列等方式选择一个或多个残基后，在结构树处会出现已选择残基添加表示，如图 6 所示。可以给已选择残基添加表示。

图 6 已选择残基添加表示