Inno-SA
1. Inno-SA 概述
Inno-SA 模块主要用于预测分子中是否存在毒性子结构，包括急性毒性、遗传毒性致癌性、非遗传毒性致癌性、皮肤致敏性、水生毒性、不可生物降解、SureChEMBL 毒性、FAF-Drugs4 毒性，和造成化合物频繁命中子结构的警告。这些子结构是从大量的实验活性数据中总结出来的造成这些不良反应的高频子结构，Inno-SA 模块可以准确的识别出危险的子结构，帮助用户更加清晰的认识分子，通过警告来让用户对该部分子结构引起重视。
2. 使用说明
用户只需要三个步骤就可以完成计算：确定输入方式(输入 smiles)-任务命名(可忽略)-提交任务(必点)。
(1) 输入方式
平台提供了四种数据输入方式：输入 SMILES、绘制分子、上传文件和数据中心。
- 输入 SMILES
复选框选中“输入 SMILES”，在文本框中输入一个或多个 SMILES 表达式(用换行的方式输入多个 SMILES)，该文本框中最多可输入 500 个 SMILES(超出上限可通过上传文件的形式提交任务)。
图 1. 输入方式——输入 SMILES
- 绘制分子
复选框选中“绘制分子”，在右边的分子编辑器中画出分子结构，画好以后点击右下角的“确认”后即可。该模式下只支持画一个分子。
图 2. 输入方式——绘制分子
- 上传文件
复选框选中“上传文件”，通过点击下方按钮选择本地文件即可。选择完文件以后，该文件名称将显示在按钮上，右边将显示文件内容。 关于上传的文件：
当前支持的文件格式: .sdf/.csv；如上传 sdf 文件，则可直接提交任务，如上传 csv 文件，则需指定 smiles 列后方能提交任务。
文件大小不超过 10MB。
- 数据中心
复选框选中“数据中心”，通过点击下方按钮页面出现弹窗，点击文件名称来选择数据中心的数据，点击完之后弹窗消失，即可提交任务。
图 3. 输入方式——上传文件/数据中心
在确定好所有的参数后，命名任务名称，点击提交即完成任务提交操作。
(2) 运行进度和结果查看
提交任务后，页面会自动跳入当前页面的“最近结果”子页面中，您可以在该页面查看当前模块的任务运行状态(进度条)，也可在右上角的“运行中“下拉框中查看所有模块正在运行的任务。当数据量较大时，系统会分批计算，因此只要有一批数据算完后(整个任务还在运行中)，即可点击“结果详情”按钮进入结果页面，查看当前已完成计算的预测结果列表(未完成计算的分子暂不显示)，并且可以在当前页面通过刷新来获取最新算完的数据。
图 4. 查看结果
3. 结果分析
结果页面由顶部的筛选区、Summary 和中部的结果详情组成。默认状态下看到的是列表页面，在结果列表中可以看到该分子在某类别下的子结构警告数量，通过点击该数字，可以看到相应的子结构警告（由红色突出显示）。此外用户可以用户可对这些类别进行排序、筛选。
图 5. 结果页面功能分布
图 6. 子结构警告弹窗
(1) 颜色定义
我们通过颜色对预测结果做了直观的评估，以此帮助用户更直观的了解分子的评价结果。绿色背景越多，说明分子中包含的子结构警告数量越少。颜色设置的规则如下：
Alerts = 0，数值的底色为绿色，代表化合物不包含任何子结构警告；
0 < Alerts ≤ 3，数值的底色为黄色，代表化合物包含子结构警告，且数量小于等于 3；
Alerts > 3，数值的底色为红色，代表化合物包含的子结构警告数量大于 3。
(2) 规则
当前模块检测的子结构警告种类包括 Acute Toxicity, Genotoxic, NonGenotoxic, Skin Sensitization, Aquatic Toxicity, NonBioDegradable, SureChEMBL, FAF-Drugs4, FH Alerts
(3) 筛选
平台提供了常规筛选以满足用户的使用需求。
- 常规筛选
常规筛选可以显示/隐藏性质。默认的结果列表展示计算的所有性质，此时左边控制栏中为全选的状态。当你不想显示该性质时，取消该性质的选中即可，左边的结果列表将根据控制栏中的选择进行实时显示。在顶部还提供了两个快捷键“全选”和“不选”，方便用户快速选择。
(4) 类别解释
把鼠标移入每个类别的名称上，可查看该类别对应的解释。
(5) 排序
点击结果列表中的类别名字可重新排序，如 Acute Toxicity，点击一次为升序，再点一次为降序，再点一次即恢复原始排序。
(6) 隐藏无效分子
针对 SMILES 错误或者后台无法解析的分子，算法无法进行正确的计算，在这种情况下，任务不受影响，但分子被定义为无效分子。用户可以通过“隐藏无效分子”的按钮，快速过滤掉该部分的分子。
4. 相关文献
暂无